故事讲述了在21世纪初，由于世界大战的展开而造成了庞大的损坏。人类决定脱离地球，前往宇宙生活，新世代的统治者——超银河联合政府认为“演艺”和“歌曲”是扰乱人心之物，所以强硬实行“演艺禁止法”。就只有演艺人爱好者的圣地秋叶原，可以展开一个“演艺绝对防卫圈”，与执政者展开持久对抗。大部分人的心灵，就此被黑暗包围。就在这时候，一个以“AKB0048”名义演出的组合出现了。成员们旨在继承当年为地球战争受难者表演到最后一秒的AKB48，把传说中“奇迹Live”的希望、光辉和灵魂交予丢失梦想的人们。然而，这队组合不但惹上非法的问题，甚至因可怕的影响力而被冠以恐怖份子之名，在演出时遭受各种干扰。为了捍卫自身演出的自由以及爱好者与市民的享受，AKB0048的第77期研究生终于亲自拿起武器，保护自己的舞台。